《東方永夜抄》是一款東方題材的彈幕游戲，濃烈的色彩感和豐富的游戲性打動著每一位玩家，感受東方幻想鄉的世界真諦。

正當夏季要過去的時候，幻想鄉又再一次發生異變。本來在這一晚里會出現滿月，但是月亮似乎因為某些事故以無法完整出現。這情況對人類來說沒有什么特別，但對妖怪來說則是攸關生死的問題。在幻想鄉的境界棲息的妖怪－八云紫察覺到這次異變的發生，因為自己一個人不方便行動，所以就邀請了博麗神社的巫女－博麗靈夢一同出發解決異變。

在魔法森林居住的魔法使－愛莉絲·瑪嘉托洛伊德看見沒有人要去解決異變之下，找來了同樣住在魔法森林的人類－霧雨魔理沙作為同伴出發。紅魔館的主人－吸血鬼蕾米莉亞·斯卡蕾特，把家事交托給十六夜咲夜后就自行出發了。但最后咲夜還是跟上了蕾米莉亞一起行動。白玉樓的主人－亡靈西行寺幽幽子則隨便地與庭師－魂魄妖夢出外東西四走。以一人一妖組成的四個組別，為了讓滿月能再次出現，于是在幻想鄉中四處巡回。