《超級機器人大戰α》這款游戲是一款角色扮演類的動作冒險游戲，在游戲中玩家們將在游戲中體驗駕駛新的機甲加入到全新的戰役中去。
本作劇情主線不再圍繞DC戰爭了，而是自新機戰起加入的原創系作品《超機大戰SRX》所貫穿的主線“巴爾瑪帝國戰役”，加入了許多新的機體和作品。地圖與之前在《魔裝機神》中曾經運用過的45度角立體地圖一樣，能令玩家非常真切地感覺到地形的高低差。
本作的一大亮點是首次加入了熟練度這一新的設定，熟練度的高低將會影響許多方面，諸如玩家能否得到隱藏機體、隱藏武器、每話出現的敵人多寡難度以及金錢的多少等等；并新增機體換裝指令；另一小改進是當機師的擊墜數超過50機成為“王牌機師”后，每次登場氣力初始值為105，這是一個很好的設計。
布魯克林·拉克菲爾德（ブルックリン?ラックフィールド，聲優：杉田智和）
認真且富正義感。愛稱是是布里德（ブリット）。戰后加入DC，擔當人型機動兵器的測試駕駛員。精通劍道、有時會對日本文化產生誤會的設定在OG系列也存在。《第2次α》《第3次α》的楠葉編亦以以楠葉的搭檔身份參戰。
水羽楠葉（クスハ?ミズハ，聲優：高橋美佳子）
內向且優柔。戰后決定成為醫生并開始相關的學習。
喜歡長時間洗澡。本作沒有制作營養飲品（楠葉汁）的興趣。OG系列是隆圣的青梅竹馬，α系列則沒有這設定。不過在《第3次α》的特別劇情中有關于此設定的對話。《第2次α》《第3次α》的楠葉以超級系主人公身份登場，并繼承了決定成為醫生的設定。另外本作中楠葉的初期設定是真實系。
蕾歐娜·加修坦因（レオナ?ガーシュタイン，聲優：雛野まよ（現?榊原由依））
沉著冷靜且頭腦清晰。戰后聽從ロイ?フォッカー和ブルーノ?J?グローバル的建議加入了SDF。
不會料理而且是音癡。和SRX小隊的萊是表兄妹關系，不過在本作沒有提及。除了音癡的設定外，其他設定在OG系列都繼續存在（音癡的設定方面，制作人寺田貴信在スパロボOGネットラジオ うますぎWAVE曾提及“曾經為了是否使用這個設定而迷惑過”。擔當聲優榊原由依曾提及“自己選拔時的音聲在游戲本編中也有被使用”。
真宮寺·祐（タスク?シングウジ，聲優：山口勝平）
樂觀且活力充沛。戰后跟破嵐萬丈一起致力于戰后復興。
喜歡測試自己的運氣。手工很靈巧。好女色，雖然反應很快但其實是運動白癡的設定在OG系列也存在。
游戲開始時要先進行主人公的設定。雖然聲優只能根據性格轉變，但名字與外貌則可以任意變更，而根據生日則可以習得不同的精神指令。超級系的機體是古倫加斯特弐式和龍虎王。真實系則為兇鳥Mk-II和兇鳥Mk-III。
主人公和戀人的背景設定方面，超級系是跟兜甲兒一樣為東城學園的高校生，真實系則為毛氏工社的社員。兩者皆于序盤突然被卷入戰斗，然后戀人失蹤。之后主人公成為隆巴納隊的一員，而戀人則失去了記憶并被伊魯姆保護。雖然伊魯姆與戀人曾因為個人目的而與隆巴納隊戰斗，但最終也會加入我方。順帶一提，不論主人公是超級系還是真實系，戀人的能力都是偏向超級系的。
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