《囧魂》一如既往地，故事開始在一天清晨。那個普通的早上，一位普通的少年在一間普通的房屋里醒來，發現自己的床邊站著一個不普通的大叔，并給了他新的名字……

在早飯的誘惑下，發現自己莫名其妙地掉落到二次元世界的少年接受了不屬于自己的名字，也接受了隨之而來的一系列RP命運，甚至結交了新的同伴，為了返回現實而硬著頭皮向這個充滿囧和危險的世界進發。然而在這段旅程的終點，等待著他的是……

游戲中直接露過面的ACG人物共400余名，分別出自一百多部不同的作品。主線為傳統的冒險旅程式，支線內容則從婚姻介紹到尋找BUG五花八門，很多商店里買不到的高級裝備和特殊物品、乃至主角們的許多技能都是通過支線獲得的。游戲結局共六種，其中完美結局需要滿足一定的條件才能進入，所有結局都可以在一周目中通過最后的選擇達成，所以不必擔心無法看全。

游戲的基本戰斗方式是較為簡單的回合制戰斗，在此基礎上增加了合體技等按照各場戰斗的不同需要所作的修改。遇敵方式包括野外的暗雷遇敵和通過與NPC對話、參加天空競技場挑戰賽等方式觸發的明雷，在游戲后期的某地點還有機會重新挑戰包括BOSS在內的各種強敵，如果早期被虐了可以帶著后期的高等級跑去復仇……

戰斗以外的游戲系統也是盡力以簡潔實用為第一優先，在此基礎上盡可能地加入了各種增加趣味度和便利性的細節。

整個游戲中共有20余張可以隨時在相冊中回顧的原創CG，Gameover圖和片尾動態圖也都是用特別繪制的原創圖制作的。主角四人組的頭像和戰斗圖均為自繪，此外還有大量原創或自改行走圖和部分原創的技能動畫、地圖圖塊、物品圖標等。NPC頭像和戰斗圖則多數來自原作，有部分是以原作為基礎修改或自繪的，幾乎所有NPC都有自己的頭像。